癫痫主要是由遗传因素和脑损害所共同决定的，前者是发病的基础(内因)，后者是发病的条件(外因)，只是不同患者两者作用的比重不同而已。
(1)内因：遗传因素是癫痫(包括原发性和继发性)发病的基础已毋庸置疑。体现在如下几方面：
①癫痫发病具有家族聚集性：据统计，癫痫患者的亲属患病率为3％~17.8％，其中大发作为3.2％~3.4％，失神发作为3％~13.5％，非典型失神发作为3.1％~12.5％，婴儿痉挛症为0.3％~3.8％，简单部分发作为1.1％，复杂部分发作为l％~1.7％，混合型发作为4.3%~6.5％，均高于一般人群的患病率(一般为0.2％~0.7％)，且原发性者高于继发性。目前认为典型失神发作和良性儿童期癲痫伴中央一颞棘波均为常染色体不完全性显性遗传，良性家族性新生儿惊厥为常染色体显性遗传，良性儿童期肌阵挛发作为常染色体隐性遗传，单纯性发热惊厥可能为多基因遗传或常染色体不完全性显性遗传。
②家系脑电图异常率：据统计，癫痫患者近亲脑电图异常率为46.6％，其中父母为35.2%，同胞为37.%，子女为58.4％。原发性近亲脑电图癫痫波携带率为27.7％，其中父母为9.2％，同胞为46.2％，而对照组分別为10.7％、5.9％和15.5％。癫痫家系脑电图癫痫波携带率为48％，明显高于正常对照的2％。
③双生子研究：据统计，单卵双生子癫痫发病的一致率为37％~8.％(平均为60％)，双卵双生子则为3％~32％(平均13％)。而脑电图异常的一致率分别为69％~80％和2％~36％。
④染色体和基因研究：有报道，癫痫患者3号染色体短臂l区4带断裂率(染色体脆性)高于正常人。目前已经定位的癫痫基因有三个：即良性家族性新生儿惊厥定位在20号染色体上，良性少年型肌阵挛型癫痫定位在6号或15号染色体(常染色体隐性遗传)上。
(2)外因
①先天畸形：如染色体畸变、先天性脑积水、小头畸形、脑皮质发育不良等。
②围生期疾病：产伤是婴儿期继发性癫痫的常见原因。
③脑损伤。
④感染：见于各种细菌性、病毒性、真菌性脑膜炎、脑炎、脑脓肿及脑寄生虫病。
⑤中毒：铅、汞、一氧化碳、乙醇(酒精)及各种药物中毒等均可引起癫痫。
⑥颅内肿瘤：如脑膜瘤、胶质细胞瘤和转移瘤等。
⑦脑血管疾病：脑梗死、脑出血、蛛网膜下腔出血、脑血管畸形和高血压脑病等。
⑧营养、代谢性疾病：佝偻病、低血糖、糖尿病、甲状腺功能亢进、甲状旁腺功能减退、维生素B6缺乏症等。
⑨变性疾病：如阿尔茨海默(Alzheimer)病。
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